MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori SNT49 chromosome

Total Repeats: 29190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017376	GAGC	2	8	28	35	25 %	0 %	50 %	25 %	385226253
2	NC_017376	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	385226253
3	NC_017376	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385226253
4	NC_017376	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	385226253
5	NC_017376	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385226253
6	NC_017376	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	385226253
7	NC_017376	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	385226253
8	NC_017376	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385226253
9	NC_017376	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385226253
10	NC_017376	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	385226253
11	NC_017376	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385226254
12	NC_017376	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	385226254
13	NC_017376	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385226254
14	NC_017376	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	385226254
15	NC_017376	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385226254
16	NC_017376	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	385226254
17	NC_017376	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385226254
18	NC_017376	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385226254
19	NC_017376	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	385226255
20	NC_017376	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385226255
21	NC_017376	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385226255
22	NC_017376	GCC	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385226255
23	NC_017376	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385226255
24	NC_017376	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385226255
25	NC_017376	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	385226255
26	NC_017376	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	385226255
27	NC_017376	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	385226255
28	NC_017376	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	385226255
29	NC_017376	TAA	2	6	1358	1363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385226255
30	NC_017376	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385226255
31	NC_017376	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	385226255
32	NC_017376	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	385226255
33	NC_017376	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	385226255
34	NC_017376	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385226255
35	NC_017376	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385226255
36	NC_017376	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385226256
37	NC_017376	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	385226256
38	NC_017376	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	385226256
39	NC_017376	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	385226256
40	NC_017376	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385226256
41	NC_017376	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	385226256
42	NC_017376	TTAT	2	8	1856	1863	25 %	75 %	0 %	0 %	385226256
43	NC_017376	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	385226256
44	NC_017376	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385226256
45	NC_017376	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	385226256
46	NC_017376	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385226256
47	NC_017376	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385226256
48	NC_017376	TCA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385226256
49	NC_017376	TTAA	2	8	2057	2064	50 %	50 %	0 %	0 %	385226256
50	NC_017376	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385226256
51	NC_017376	ATA	2	6	2132	2137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385226256
52	NC_017376	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385226256
53	NC_017376	G	6	6	2189	2194	0 %	0 %	100 %	0 %	385226256
54	NC_017376	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	385226256
55	NC_017376	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	385226257
56	NC_017376	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	385226257
57	NC_017376	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	385226257
58	NC_017376	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	385226257
59	NC_017376	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	385226257
60	NC_017376	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	385226257
61	NC_017376	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	385226257
62	NC_017376	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385226257
63	NC_017376	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385226257
64	NC_017376	CAAA	2	8	3101	3108	75 %	0 %	0 %	25 %	385226257
65	NC_017376	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385226257
66	NC_017376	TGC	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385226258
67	NC_017376	GAA	2	6	3249	3254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385226258
68	NC_017376	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	385226258
69	NC_017376	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	385226258
70	NC_017376	GGT	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385226258
71	NC_017376	CTA	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385226258
72	NC_017376	A	6	6	3867	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	385226258
73	NC_017376	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385226258
74	NC_017376	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385226258
75	NC_017376	GCTT	2	8	5372	5379	0 %	50 %	25 %	25 %	385226259
76	NC_017376	CATT	2	8	5443	5450	25 %	50 %	0 %	25 %	385226259
77	NC_017376	ATT	2	6	5465	5470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385226259
78	NC_017376	TGG	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385226259
79	NC_017376	A	6	6	5675	5680	100 %	0 %	0 %	0 %	385226259
80	NC_017376	A	6	6	5717	5722	100 %	0 %	0 %	0 %	385226259
81	NC_017376	CATT	2	8	5752	5759	25 %	50 %	0 %	25 %	385226259
82	NC_017376	GTT	2	6	5765	5770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385226259
83	NC_017376	TAA	2	6	5834	5839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385226259
84	NC_017376	TTA	2	6	5892	5897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385226259
85	NC_017376	GTG	2	6	5961	5966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385226259
86	NC_017376	GTT	2	6	5981	5986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385226259
87	NC_017376	GC	3	6	6023	6028	0 %	0 %	50 %	50 %	385226259
88	NC_017376	TGT	2	6	6082	6087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385226259
89	NC_017376	GTT	2	6	6162	6167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385226259
90	NC_017376	TTTGA	2	10	6236	6245	20 %	60 %	20 %	0 %	385226259
91	NC_017376	GCTTGC	2	12	6267	6278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385226259
92	NC_017376	AGA	2	6	6314	6319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385226259
93	NC_017376	GTT	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385226259
94	NC_017376	CGA	2	6	6388	6393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385226259
95	NC_017376	TGCT	2	8	6562	6569	0 %	50 %	25 %	25 %	385226259
96	NC_017376	CCA	2	6	6630	6635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385226259
97	NC_017376	CTA	2	6	6657	6662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385226259
98	NC_017376	CAT	2	6	6688	6693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385226259
99	NC_017376	CAT	2	6	6703	6708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385226259
100	NC_017376	GTTT	2	8	6717	6724	0 %	75 %	25 %	0 %	385226259
101	NC_017376	TGT	2	6	6763	6768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385226259
102	NC_017376	TTG	2	6	6803	6808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385226259
103	NC_017376	TGGT	2	8	6917	6924	0 %	50 %	50 %	0 %	385226259
104	NC_017376	CCGTTC	2	12	6960	6971	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385226259
105	NC_017376	CCG	2	6	7012	7017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385226259
106	NC_017376	ATCG	2	8	7100	7107	25 %	25 %	25 %	25 %	385226259
107	NC_017376	ATTG	2	8	7112	7119	25 %	50 %	25 %	0 %	385226259
108	NC_017376	GCT	2	6	7127	7132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385226259
109	NC_017376	CGTT	2	8	7135	7142	0 %	50 %	25 %	25 %	385226259
110	NC_017376	GTT	2	6	7157	7162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385226259
111	NC_017376	CAT	2	6	7657	7662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385226260
112	NC_017376	GCC	2	6	7663	7668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385226260
113	NC_017376	TCT	2	6	7724	7729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385226260
114	NC_017376	GAAACC	2	12	7772	7783	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385226260
115	NC_017376	AAT	2	6	7822	7827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385226260
116	NC_017376	CTT	2	6	7830	7835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385226260
117	NC_017376	TTCA	2	8	7900	7907	25 %	50 %	0 %	25 %	385226260
118	NC_017376	CGC	2	6	7914	7919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385226260
119	NC_017376	CAT	2	6	7920	7925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385226260
120	NC_017376	GC	3	6	7967	7972	0 %	0 %	50 %	50 %	385226260
121	NC_017376	ATG	2	6	7973	7978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385226260
122	NC_017376	TCA	2	6	7997	8002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385226260
123	NC_017376	AAATGC	2	12	8009	8020	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385226260
124	NC_017376	CCG	2	6	8051	8056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385226260
125	NC_017376	CTT	2	6	8070	8075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385226260
126	NC_017376	CAT	2	6	8103	8108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385226260
127	NC_017376	T	6	6	8119	8124	0 %	100 %	0 %	0 %	385226260
128	NC_017376	GCA	2	6	8147	8152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385226260
129	NC_017376	AG	3	6	8179	8184	50 %	0 %	50 %	0 %	385226260
130	NC_017376	TCTT	2	8	8194	8201	0 %	75 %	0 %	25 %	385226260
131	NC_017376	CAT	2	6	8274	8279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385226260
132	NC_017376	GTG	2	6	8306	8311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385226260
133	NC_017376	TTC	2	6	8386	8391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385226260
134	NC_017376	CCG	2	6	8405	8410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385226260
135	NC_017376	TTTCT	2	10	8436	8445	0 %	80 %	0 %	20 %	385226260
136	NC_017376	CAC	2	6	8506	8511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385226260
137	NC_017376	GAT	2	6	8548	8553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385226260
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